Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms