Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3H9

5530401A14Rik, RIKEN cDNA 5530401A14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5530401A14RikQ9D3H9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5530401A14RikQ9D3H9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms