Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6bQ9D289 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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