Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms