Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mrpl28Q9D1B9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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