Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms