Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bud23Q9CY21 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms