Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RpainQ9CWY9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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