Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms