Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms