Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma8Q9CWH6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms