Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH1

Zbtb8a, Zinc finger and BTB domain-containing protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb8aQ9CWH1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbtb8aQ9CWH1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbtb8aQ9CWH1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms