Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atxn3Q9CVD2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms