Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms