Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CRC3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CRC3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CRC3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms