Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms