Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhl28Q9CR40 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl28Q9CR40 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms