Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms