Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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