Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Commd4Q9CQ02 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Commd4Q9CQ02 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms