Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nsmce3Q9CPR8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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