Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab27bQ99P58 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab27bQ99P58 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms