Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pink1Q99MQ3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pink1Q99MQ3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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