Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd1Q99MH6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms