Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d1Q99MB3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d1Q99MB3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms