Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp1b1Q99LU0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms