Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms