Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf2Q99LE6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms