Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlgn1Q99K10 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms