Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pacsin3Q99JB8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin3Q99JB8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms