Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apobec3Q99J72 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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