Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim7Q923T7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms