Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Med28Q920D3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms