Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl3Q91YH5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl3Q91YH5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms