Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Synpo2Q91YE8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Synpo2Q91YE8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms