Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SelenomQ8VHC3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms