Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8VDP2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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