Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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