Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpap2Q8VC34 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms