Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp4Q8R2N2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp4Q8R2N2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms