Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf183Q8QZS5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf183Q8QZS5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf183Q8QZS5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf183Q8QZS5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf183Q8QZS5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf183Q8QZS5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf183Q8QZS5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnf183Q8QZS5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rnf183Q8QZS5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rnf183Q8QZS5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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