Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms