Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NgefQ8CHT1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NgefQ8CHT1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms