Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG79

Tp53bp2, Apoptosis-stimulating of p53 protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp2Q8CG79 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tp53bp2Q8CG79 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms