Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ercc8Q8CFD5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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