Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp20Q8C6M1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Usp20Q8C6M1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Usp20Q8C6M1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Usp20Q8C6M1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp20Q8C6M1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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