Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C3W1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms