Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssuh2Q8C3L1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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