Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q2

Zhx3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zhx3Q8C0Q2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zhx3Q8C0Q2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms