Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms